Le MBR a dû être installé sur le disque dur d'un terra-octet. D'où l'impossibilité de booter sur la grappe RAID une fois le disque enlevé. La partition de 100 Mo à 200 Mo invisible, fait quant à elle partie de Windows 7, elle est réservée au système et contient l’environnement de récupération WinRE permettant de récupérer le système en cas de problème de démarrage (option Réparer l’ordinateur dans les options avancées de démarrage - F8 pendant le démarrage).
Tout ceci est arrivé parce que ton disque principal (ordre de boot dans le bios) n'était pas la grappe RAID mais ton disque de 1 To, tout simplement. Une erreur vraiment très courante.

Il va donc falloir que tu recours à un soft du genre Norton Ghost ou Acronis True Image pour déplacer le MBR sur ta grappe RAID. Je me rappelle plus si les softs gratuits comme Gparted sont capables de le faire. Mais une recherche google devrait t'aider. D'autant plus que je suis à peu près certain que la suite Hiren's boot contient les outils nécessaires pour le faire.